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COVID-19 संकट: मुंबई चालक दल एल्गोरिदम विकसित करता है जो कम परीक्षणों के साथ अतिरिक्त रोगियों का आकलन करता है, अनुमोदन की प्रतीक्षा करता है

covid-19-संकट:-मुंबई-चालक-दल-एल्गोरिदम-विकसित-करता-है-जो-कम-परीक्षणों-के-साथ-अतिरिक्त-रोगियों-का-आकलन-करता-है,-अनुमोदन-की-प्रतीक्षा-करता-है

अतीत में लगभग पांच साल, मनोज गोपालकृष्णन, इंडियन इंस्टिट्यूट ऑफ़ एक्सपर्टिस (IIT) बॉम्बे के एक प्रोफेसर, ने मिडल ईस्ट रेस्पिरेटरी सिंड्रोम कोरोनोवायरस या MERS-COST प्रकोप

के संबंध में सुना। तथ्यों को जानें किट्स को आज़माने की कमी के बारे में चर्चा करें और अगर प्रयास के एक आविष्कार के रूप में पूलिंग करके हैरान हो जाएँ, जहाँ नमूने एक बैच में सामूहिक रूप से मिश्रित होते हैं और अतिरिक्त परीक्षण किए जाते हैं यदि मिश्रित नमूना आकलन सुनिश्चित होते हैं, तो संभवतः संभवतः यह मौका बहुत ही चालाकी से बाहर होगा। तिथि निकालने की कोशिश कर रहा है।

लेकिन उसके बाद फिर से, उसके दिमाग में सबसे सरल पद रहा।

जल्दी में 2020, COVID के रूप में – 23 मनोज ने अंतरराष्ट्रीय स्तर पर हंगामा किया, मनोज ने देखा, जितनी जल्दी हो, सभी आकलन की कमी है। हालांकि इस बार परिष्कृत पूलिंग समाधानों में उल्लेखनीय अतिरिक्त जिज्ञासा थी।

मनोज, उनके पीएचडी छात्र सब्यसाची घोष, सहकर्मी और गणितज्ञ अजीत राजवाडे के साथ, और आईआईटी-बॉम्बे में विभिन्न स्वयंसेवकों के बहुत सारे, तारीख से बाहर। गणितीय मॉडलिंग और बड़े आकार की स्क्रीनिंग के लिए पूल के नमूनों के समाधान पर सिद्धांतों को बचाने के लिए एक एल्गोरिथ्म विकसित किया।

उनकी सहज, टेपेस्ट्री पूलिंग, इन दिनों $ के ओपन इनोवेशन म्यूजिक में एक फाइनल है 500, 000 XPRIZE, एक विश्व COVID – 640 विरोधियों का प्रयास।

) यह वास्तविकता में कैसे काम करता है

मनोज प्रस्तुत करने के लिए एक सादृश्य का उपयोग करता है: प्रयास करने की परियोजना, वह कहते हैं, एक हिस्टैक में एक सुई की खोज करने जैसा है।

लैब्स सैकड़ों नमूने प्राप्त करते हैं जो मेरे खंडित परीक्षण के लिए हो सकते हैं जो कि संक्रमित है। एक तरीका यह है कि जब तक आप निस्तारण या सुई से बचाव नहीं करते हैं, तब तक एक संक्रमित प्रभावित व्यक्ति के नमूने पर ब्लेड से ब्लेड से संघर्ष करना है। या आप पोलीमरेज़ चेन रिस्पॉन्स (पीसीआर)

का उपयोग एक घातीय खोज प्राप्त करेंगे, हालांकि चूंकि बड़े पैमाने पर आबादी COVID से संक्रमित हैं – , परियोजना, मनोज के अनुसार, अब मूल्यांकन का या एक हीस्टैक में एक सुई की खोज करने का नहीं है, फिर भी यह पहचानना कि कौन सा haystacks या जमा नमूनों में सुइयां हैं।

डोरफ़मैन कार्यप्रणाली व्यापक रूप से नमूनों को आज़माने का एक पुराना तरीका है। इसके नीचे, नमूने के एक जोड़े की तुलना में अधिक समान रूप से पूल किए जाते हैं और जैसे ही जांच की जाती है। यदि पूल या सामुदायिक आकलन हानिकारक है, तो यह पहचाना जाता है कि प्रत्येक विशेष व्यक्ति के नमूने हानिकारक पर एक नज़र रखते हैं। हालाँकि यदि यह सुनिश्चित होता है कि उस समुदाय के प्रत्येक नमूने को मेरे टुकड़े के लिए रखा गया है।

मनोज का दल पूछ रहा है कि क्या आपके पूरे आकलन में संभवत: यह संभव हो सकता है कि एक ही दौर में बहुत चालाकी से प्रदर्शन किया जाए। टेपेस्ट्री पूलिंग के नीचे, नमूनों को कई समूहों में जोड़ दिया जाता है और सकारात्मकता के नाम पर एक साथ परीक्षण किया जाता है।

टेपेस्ट्री ने एक एंड्रॉइड उपयोगिता भी जारी की है जो संभवतः प्रति मौका अच्छी तरह से वापस प्रयोगशालाओं में अपने प्रोटोकॉल का प्रयास करने पर लागू होगा। टेंपरेरी पूलिंग के साथ स्वेच्छा से काम करने वाले और अब उत्पाद पर्यवेक्षक शम्पा सिंह ने इस प्रोटोकॉल को प्राप्त करने के लिए केंद्रों को बंद करने के रिकॉर्ड बनाने से लेकर रिकॉर्ड बनाने के बारे में मोहित किया गया है। पाठ्यक्रम बंद करने का प्रयास करना: वे कितने नमूने ले रहे थे, उनकी संख्या निश्चित थी, उनके पास कौन से उपकरण थे, वे हैंडबुक या कम्प्यूटरीकृत प्रक्रियाओं का पालन कर रहे थे। ”

शम्पा ने एक प्रश्नावली तैयार की। और स्वयंसेवकों के एक दल ने समाधान प्राप्त करने के लिए केंद्रों का प्रयास करने के लिए नाम देना शुरू कर दिया। इस बीच, मनोज के दल ने हार्वर्ड मेडिकल स्कूल और पायलट बैंगलोर में सिंथेटिक आरएनए के उपयोग पर पायलट कहानियों का प्रदर्शन किया।

उनके पायलट के परिणाम वर्तमान कि टेपेस्ट्री “सीधे-सीधे दो-गोल पूलिंग की तुलना में कम आकलन में प्रयास के एक दौर के साथ प्रत्येक व्यक्ति के नमूने की नियुक्ति को ठीक से पहचानती है।”

COVID-19 testing. Representation Image. Courtesy: Mufid Majnun, Unsplash

) तरीके को लागू करना

हालांकि जब स्वयंसेवकों ने अपने प्रोटोकॉल को लागू करने के बारे में केंद्रों से प्रयास करने की सलाह देना शुरू किया, तो उन्होंने महसूस किया कि एंड्रॉइड ऐप मध्यम नहीं था स्प्रेडशीट पर लगे रहने के लिए केंद्रों के अनुकूल, इसलिए उन्होंने एक वेब ऐप हासिल करना शुरू कर दिया।

शम्पा बताती हैं कि पूलिंग समाधानों के लिए प्रयास केंद्रों का ध्यान नहीं गया था। हालाँकि, बड़े आकार का पूलिंग मुश्किल है।

यदि एक हजार नमूनों का परीक्षण किया जाना है, तो वे दोनों मेरे खंडित परीक्षण के लिए होंगे या अधिग्रहण करने के लिए तैयार होंगे 100 प्रतिक्रियाओं “हर नमूने में, बोली व्यक्ति का RNA 1, 2, और 3 में होगा, इसलिए जब तक सभी सुनिश्चित नहीं हो जाते, तब तक हम किसी व्यक्ति विशेष पर बोली लगाने वाले नहीं हैं। इसी प्रकार, किसी व्यक्ति विशेष के लिए २ व्यक्ति । लैब्स अब मैन्युअल रूप से इसका निर्माण नहीं कर सकते हैं, जहां टेपेस्ट्री की पूलिंग की व्यवस्था है, “शम्पा कहती है

क्रू ने एक डैशबोर्ड बनाया जहां लैब अपने पैरामीटर्स को एक जोड़े से अधिक जोड़े के बराबर करने का प्रयास कर सकते हैं। नमूने और व्यापकता दर (बीमारी का एक आबादी का हिस्सा), जबकि एल्गोरिथ्म एक पूलिंग मैट्रिक्स को कॉन्फ़िगर करता है और मूल्यांकन चलाता है।

इस वेब ऐप, आकांक्षा व्यास, जो कि थी को हासिल करने में तीन महीने लग गए। दृष्टिकोण के संबंध में मोहित, कहते हैं। वह कहती हैं, “हमें यह निर्धारित करने की आवश्यकता है कि हम त्रुटियों के इच्छुक होने के बिना पूलिंग दिशाओं को कैसे और प्रभावी ढंग से पेश करेंगे,” वह कहती हैं।

हालांकि मैट्रिक्स के बजाय जो केंद्रों के पूल के नमूनों को बाहर निकालने में मदद करता है और व्यक्ति को संकेत देता है। प्रभावित व्यक्ति आईडी या संख्या के माध्यम से, टेपेस्ट्री भी मल्टी चैनल pipetting के माध्यम से मौजूदा pipetting रणनीति को बेहतर बनाने पर काम किया, Shampa कहते हैं। पिपेटेटिंग एक तरल पद्धति है, जो विंदुक के रूप में जानी जाने वाली एक पतला ट्यूब के उपयोग के तरल भागों को मापने और स्थानांतरित करने की एक प्रयोगशाला पद्धति है। “यह करने का प्रयास किया गया था और समय को संलग्न करने का प्रयास किया।”

टेपेस्ट्री का दावा है कि इसकी पूलिंग “कम प्रसार (<1 पीसी) पर बड़े आकार की आबादी की स्क्रीनिंग के लिए महत्वपूर्ण है, जहां यह प्रदर्शन करता है 10 आसान पूलिंग दृष्टिकोण से बचत के संबंध में कई बार बेहतर जो पारंपरिक से बाहर है तिथि का कारण ""

वे हैं जिनके पास ये परिणाम मिलने के बाद “पूलित आरएनए निकाले गए” प्रभावित व्यक्ति के नमूनों से जो पहले कोविद 04 थे ”। हालाँकि, अभी तक उनके समाधानों की कोई बड़े पैमाने पर तैनाती नहीं हुई है।

एल्गोरिथ्म और वेब ऐप का निर्माण, मनोज कहते हैं, विनियामक अनुमोदन प्राप्त करने से अधिक आसान रहा है। चूंकि वे द सेंट्रल रेमेडी रेगुलर डिफेंड वॉच ऑन ऑर्गनाइजेशन (सीडीएससीओ) से अनाप-शनाप इंतजार करते हैं, टेपेस्ट्री संस्थान की आचार समिति की आंतरिक मंजूरी के जरिए IIIT-Hyderabad में एक क्षेत्र का पता लगाने की योजना बना रही है।

“अब” टीका यहाँ है, प्रचलित दृष्टिकोण यह है कि महामारी खत्म हो गई है। हालांकि टीकों के आवंटन IV परीक्षण बाकी हैं। इस तरह की व्यवस्था के लिए व्यापक स्तर पर प्रयास करने की आवश्यकता वास्तव में महान हो जाती है, ”मनोज कहते हैं।

(टेपेस्ट्री) संभवत: प्रति मौका शायद अच्छी तरह से शायद भारतीय नियामकों द्वारा मान्यता प्राप्त नहीं होगी, फिर भी। वे XPRIZE के फाइनल में पहुंचने के लिए बेहतरीन भारतीय चालक दल हैं। वैश्विक विरोधियों ने अपने काम के लिए अतिरिक्त प्रोत्साहन दिया है; यदि आईआईटी-जोधपुर से भारतीय विज्ञान संस्थान के लिए कई प्रतिष्ठानों के साथ बातचीत शुरू करने के बारे में उन्हें बताया जाता है।

हालांकि, नियामक अनुमोदन के बिना, ताप्ती के बड़े पैमाने पर सुधार के प्रयास संभवतः प्रति मौका अच्छी तरह से संभवत: अवास्तविक बने रहेंगे। ।

यह लेख पहली बार सिटीजन मैटर्स , एक नागरिक मीडिया वेब पेज में छपा था और इसे पुनः प्रकाशित किया गया है यहाँ अनुमति के साथ। (c) 20209742 ओरवानी फाउंडेशन / ओपन मीडिया इनिशिएटिव

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